需要鑒定蛋白的寶寶集合啦

時間:2019-07-19


不得不感慨科技發展的迅猛,學科串聯下,我們能通過越來越便捷的方法去實現我們的想法,各種與數字信息化結合的升級版儀器,各類生物信息分析軟件都讓人眼花繚亂,蛋白組學雖說發展史不久,可鑒定蛋白的技術已是非常成熟,特別是液質聯用技術的出現,為我們的蛋白組學帶來更多的可行性和可實現性。寶寶們,走過路過不要錯過,青蓮百奧給您送去“規范,精細,高效”優質服務,各種福利大放送,性價比絕得扛得住比較,值得各位小伙伴兒們種草哈(*^▽^*)~


【產品簡介】
青蓮百奧可零壓力實現對蛋白質全譜(shotgun)和蛋白質膠點/膠條/溶液混合物(SDS-PAGE,IP產物,Pull down產物)的鑒定,單蛋白或豐度較高樣本(體外泛素化、體外磷酸化、IP富集產物)乙酰化、磷酸化、琥珀酰化、泛素化、甲基化、糖基化等多種翻譯后修飾位點鑒定。采用HPLC-MS/MS高效液相色譜-質譜聯用技術,液相色譜作為分離技術,質譜作為檢測系統,完成對樣本的定性分析。液質聯用的優勢即液相對復雜樣品的高分離能力與質譜的高選擇性、高靈敏性相結合,目前,在藥物分析、食品分析和環境分析等許多領域的到了廣泛的應用。


【技術平臺】
青蓮百奧質譜平臺

Q ExactiveTM組合型四級桿Orbitrap;
Q ExactiveTMHF組合型四級桿Orbitrap;
Orbitrap FusionTMTribridTM;
Orbitrap FusionTMLumosTMTribridTM三合一,任君挑選。


【技術原理】
HPLC-MS/MS高效液相色譜-質譜聯用技術
(1)蛋白樣品酶解成肽段;
(2)肽段在HPLC中分離;
(3)分離的肽段進入質譜進行離子碎片化;
(4)經過質譜質量分析器檢測器得到譜圖;
(5)譜圖信息經過生物信息統計分析,得到譜圖的注釋信息;
(6)生成樣品鑒定報告。

【送樣標準】
樣品為膠點、膠條或泳道時,要求條帶清晰,無降解。
蛋白溶液進行SDS-PAGE電泳,兩種電泳方式任選其一:
(1)蛋白洗脫液,跑分離膠5cm(不含濃縮膠的SDS-PAGE),切下5cm膠條,放入1.5ml離心管中。
(2)蛋白洗脫液,跑SDS-PAGE標準的膠,切下目標條帶即可,放入1.5ml離心管中。


【數據展示】
1. 色譜圖(BPC base peak chromotography)



2. 數據庫
數據庫的選擇是以所測物種、數據庫注釋完備性及序列可靠性為參考依據的。在選擇數據庫時,遵循如下原則:若公共蛋白數據庫比較全面,直接選用該物種蛋白質組數據庫;若公共蛋白質組數據庫很小,則可以選擇與被測樣品最為相關的大類蛋白質組數據庫,也可以用此物種的轉錄組或者基因組翻譯的蛋白質數據庫。
搜庫參數一并附于鑒定報告中。

3. 原始質譜數據
產生的質譜原始文件Maxquant進行搜庫及定量分析。

4. 鑒定結果統計

表注:鑒定基本信息統計。
第一列為樣品編號;
第二列為譜圖總數;
第三列是鑒定譜圖數,即與肽段匹配的離子得分大于鑒定閾值的譜圖的個數;
第四列是鑒定肽段數,即與鑒定譜圖所對應的肽段去重復之后的個數;
第五列是鑒定蛋白數,即與鑒定肽段所對應的蛋白個數,這些蛋白擁有至少一個獨有的鑒定肽段;

5.蛋白質的注釋,如果有要求也是可以滿足的~~

【服務周期】



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